Большую часть Страны Басков занимают горные массивы, образованные Кантабрийским хребтом (Баскскими горами) и отрогами Пиренейских гор. Ближе к побережью горы сменяются красивыми долинами, заливами и бухтами. Климат в регионе умеренный морской.

Живописные пейзажи в сочетании с горно-морским воздухом, насыщенным ароматами хвойных пород деревьев и пахучих луговых пастбищ, делают эту местность привлекательной для любых видов туризма.

Северные долины провинций Бискайя, Гипускоа и Алава, выходящие к Бискайскому заливу (Атлантическому океану), образуют зону называемую "зелёной Испанией" (Costa Verde). Росту пышной растительности в этой зоне, способствует большое количество осадков, выпадающих на горные склоны и в долинах, а также комфортные среднегодовые температуры. Здесь не холодно зимой и не жарко летом. В январе, в Бильбао столбик термометра редко опускается ниже +10°C, а в июле средняя температура составляет +20+22°C.

В центральной и южной части автономной области климат переходит в континентальный средиземноморский. Здесь также нет изнуряющей жары летом и мороза зимой. Средняя температура августа составляет +21°C, а января +8°C. Годовое количество осадков составляет 300 мм, больше всего их выпадает в весенние и летние месяцы.

На территории Страны Басков расположено восемь заповедников. Некоторые из них, в том числе биосферный заповедник Урдайбай (Reserva dela Biosfera de Urdaibai) и природный парк Уркиола (Parque Natural de Urkiola), находятся в прибрежных районах.

В центральной части Алавской Риохи (Rioja Alavesa) находится охраняемый биотоп лагуны Лагуардия (Biotopo protegido de Laguardia). В этом озёрном крае обитает множество птиц, в том числе рыжие цапли, лысухи и шилохвости, а также большое количество земноводных.

В западной части Алавы расположен природный парк Вальдерехо (Parque Natural de Valderejo). Здесь в глубоком ущелье и долине реки Пурон (Río Puron) находится множество небольших озёр и водопадов, среди которых располагаются несколько земледельческих и животноводческих хозяйств.

Горный массив и природный парк Горбейя (Parque Natural de Gorbea) на границе Алавы и Бискайи входит в число наиболее известных достопримечательностей Страны Басков. Гора Горбейя и окружающие её пики формируют живописный скалистый ландшафт, который дополняют леса из дуба, бука, березы и сосны. На берегах ручьёв живут выдры, в лесах обитают кабаны и косули. На территории заповедника находится несколько живописных водяных мельниц.

На юге Алавы расположен один из самых крупных лесных массивов в Европе. Здесь растут пиренейские дубы и каштаны. Природный парк Уркиола (Parque Natural de Urkiola), единственный заповедник Бискайи, который находится в центральной части этой провинции. По территории парка проходит горная гряда, отделяющая Бискайю от Алавы. Этот район характеризуется скалистыми ландшафтами. Высоко в горах расположены живописные пастбища, ниже по склонам гор растут бук, ель, дуб.

Самая высокая вершина - гребень Айскори (Aizkorri) высотой 1551 метров над уровнем моря - находится на территории одноименного природного парка (Parque Natural de Aizkorri-Aratz) в провинции Гипускоа. Здесь располагается несколько пиков, поднимающихся на высоту более 1000 м. Ещё одна живописная горная цепь протянулась на территории природного парка Аралар (Parque Natural de Aralar) на границе между Гипускоа и Наваррой.

Бискайский залив и Кантабрийские (Баскские) горы создают живописный ландшафт со всеми оттенками зелёного цвета, дополняемый смешанными лесами, с множеством горных речек и озёр. В чистой и прозрачной воде горных ручьев природных парков водится форель, на берегах обитает выдра, а в лесах олень, кабан, косуля, лиса, волк, в горах хищные птицы, такие как змеиный орел и светло-коричневый гриф.